Dondurulan embriyolar, tekrar kullanılacakları zamana kadar sıvı nitrojen (-196 derecede) içinde saklanırlar. Embriyo dondurma uygulamasının temel endikasyonları şunlardır:
Transfer sonrası geride hala kaliteli fazla sayıda embriyonun bulunması Embriyoların transfer edileceği dönemde kadına ait herhangi bir sorun ortaya çıkması (örneğin hormon tedavisi sırasında yumurtalıkların aşırı uyarılması) Rahim içi zarının (endometriumun) gebelik için uygun olmayacak bir kalınlıkta olması
